MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012036	T	6	6	30	35	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012036	A	6	6	108	113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012036	A	6	6	130	135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012036	A	7	7	150	156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012036	GTCT	2	8	289	296	0 %	50 %	25 %	25 %	222530713
6	NC_012036	TTC	2	6	323	328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530713
7	NC_012036	CCT	2	6	379	384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012036	TCT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012036	TTA	2	6	411	416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012036	GGT	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530714
11	NC_012036	T	6	6	458	463	0 %	100 %	0 %	0 %	222530714
12	NC_012036	TTG	2	6	539	544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530714
13	NC_012036	AGC	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530714
14	NC_012036	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
15	NC_012036	CAA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530715
16	NC_012036	T	6	6	693	698	0 %	100 %	0 %	0 %	222530715
17	NC_012036	TCT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
18	NC_012036	TGTTAT	2	12	781	792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012036	TCAA	2	8	809	816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012036	CAC	2	6	817	822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012036	T	6	6	843	848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012036	TATT	2	8	938	945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012036	T	6	6	961	966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012036	CAGTT	2	10	977	986	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012036	TGC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012036	CTG	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012036	GTT	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012036	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012036	TAC	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012036	ACG	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012036	TAT	2	6	1193	1198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012036	ACAA	2	8	1210	1217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012036	T	6	6	1238	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	222530716
34	NC_012036	A	6	6	1244	1249	100 %	0 %	0 %	0 %	222530716
35	NC_012036	TTTTTG	2	12	1255	1266	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	222530716
36	NC_012036	TTC	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
37	NC_012036	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
38	NC_012036	TA	3	6	1429	1434	50 %	50 %	0 %	0 %	222530716
39	NC_012036	TG	3	6	1450	1455	0 %	50 %	50 %	0 %	222530716
40	NC_012036	CTT	2	6	1485	1490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
41	NC_012036	TCG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
42	NC_012036	CCTT	2	8	1532	1539	0 %	50 %	0 %	50 %	222530716
43	NC_012036	TGT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530716
44	NC_012036	GC	3	6	1899	1904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012036	T	7	7	2018	2024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012036	TCT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012036	TCG	2	6	2165	2170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012036	AG	3	6	2259	2264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012036	CTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012036	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012036	ATT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012036	TGTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012036	T	6	6	2800	2805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012036	T	6	6	2810	2815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012036	C	6	6	2822	2827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_012036	CCG	2	6	2865	2870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012036	G	6	6	2902	2907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012036	T	6	6	2947	2952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012036	T	6	6	2958	2963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012036	T	6	6	3013	3018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012036	A	6	6	3032	3037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012036	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012036	T	6	6	3087	3092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012036	T	6	6	3096	3101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012036	A	6	6	3108	3113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012036	CT	3	6	3153	3158	0 %	50 %	0 %	50 %	222530717
67	NC_012036	TGC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
68	NC_012036	CAA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
69	NC_012036	TTG	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530717
70	NC_012036	TTTTC	2	10	3384	3393	0 %	80 %	0 %	20 %	222530717
71	NC_012036	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
72	NC_012036	TAC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
73	NC_012036	GTC	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
74	NC_012036	TAT	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530717
75	NC_012036	TCT	2	6	3540	3545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
76	NC_012036	T	6	6	3549	3554	0 %	100 %	0 %	0 %	222530717
77	NC_012036	CTTT	2	8	3610	3617	0 %	75 %	0 %	25 %	222530717
78	NC_012036	TCT	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
79	NC_012036	CTT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
80	NC_012036	TGC	2	6	3876	3881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
81	NC_012036	AAC	2	6	3882	3887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
82	NC_012036	TCA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
83	NC_012036	ATTT	2	8	3956	3963	25 %	75 %	0 %	0 %	222530717
84	NC_012036	T	6	6	4031	4036	0 %	100 %	0 %	0 %	222530717
85	NC_012036	CTG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
86	NC_012036	TCA	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
87	NC_012036	ACC	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530718
88	NC_012036	TCA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
89	NC_012036	AAG	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
90	NC_012036	GCTT	2	8	4353	4360	0 %	50 %	25 %	25 %	222530718
91	NC_012036	AGA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
92	NC_012036	A	6	6	4644	4649	100 %	0 %	0 %	0 %	222530718
93	NC_012036	T	6	6	4658	4663	0 %	100 %	0 %	0 %	222530718
94	NC_012036	CCT	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_012036	T	8	8	4858	4865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012036	T	6	6	4941	4946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012036	CAG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012036	ATCC	2	8	5045	5052	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012036	CTT	2	6	5063	5068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012036	ACC	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012036	T	8	8	5210	5217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012036	GTC	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012036	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530719
104	NC_012036	T	8	8	5411	5418	0 %	100 %	0 %	0 %	222530719
105	NC_012036	T	9	9	5484	5492	0 %	100 %	0 %	0 %	222530719
106	NC_012036	TTA	2	6	5544	5549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012036	TAC	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012036	CTG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012036	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012036	TTCT	2	8	5798	5805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012036	CT	3	6	5829	5834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012036	TTTAT	2	10	5877	5886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012036	GCA	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012036	A	7	7	5962	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012036	GAC	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012036	T	9	9	6003	6011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012036	TGC	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012036	TTG	2	6	6042	6047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012036	ACAAAA	2	12	6049	6060	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012036	CTTCCT	2	12	6150	6161	0 %	50 %	0 %	50 %	222530720
121	NC_012036	TAC	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
122	NC_012036	CTT	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
123	NC_012036	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
124	NC_012036	TCAC	2	8	6401	6408	25 %	25 %	0 %	50 %	222530720
125	NC_012036	T	6	6	6558	6563	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
126	NC_012036	ATCC	2	8	6609	6616	25 %	25 %	0 %	50 %	222530720
127	NC_012036	CCAG	2	8	6617	6624	25 %	0 %	25 %	50 %	222530720
128	NC_012036	CTT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
129	NC_012036	ACCC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	0 %	75 %	222530720
130	NC_012036	CTTT	2	8	6734	6741	0 %	75 %	0 %	25 %	222530720
131	NC_012036	TTC	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
132	NC_012036	TTC	2	6	6861	6866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
133	NC_012036	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
134	NC_012036	TG	3	6	6952	6957	0 %	50 %	50 %	0 %	222530720
135	NC_012036	CTA	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
136	NC_012036	ACT	2	6	7103	7108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
137	NC_012036	TGC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
138	NC_012036	TCT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
139	NC_012036	CTGC	2	8	7276	7283	0 %	25 %	25 %	50 %	222530720
140	NC_012036	CTG	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
141	NC_012036	CTGC	2	8	7355	7362	0 %	25 %	25 %	50 %	222530720
142	NC_012036	AGC	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
143	NC_012036	GTTT	2	8	7466	7473	0 %	75 %	25 %	0 %	222530720
144	NC_012036	CAA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530720
145	NC_012036	T	6	6	7601	7606	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
146	NC_012036	TCA	2	6	7613	7618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
147	NC_012036	CTT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
148	NC_012036	ACC	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
149	NC_012036	ACC	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
150	NC_012036	TTA	2	6	7766	7771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530720
151	NC_012036	TTC	2	6	7837	7842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
152	NC_012036	TGGA	2	8	7852	7859	25 %	25 %	50 %	0 %	222530720
153	NC_012036	CTG	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
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155	NC_012036	TC	3	6	7943	7948	0 %	50 %	0 %	50 %	222530720
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159	NC_012036	GGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530720
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161	NC_012036	CAG	2	6	8090	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
162	NC_012036	T	6	6	8097	8102	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
163	NC_012036	TCG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
164	NC_012036	T	6	6	8274	8279	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
165	NC_012036	CCT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.